异地研究院

东南大学深圳研究院（2000年）

东南大学常州研究院（2007年）

东南大学镇江工业技术研究院（2009年）

东南大学盐城新能源汽车研究院（2010年）

东南大学南京通信技术研究院（2010年）

东南大学扬州研究院（2013年）

东南大学苏州医疗器械研究院（2017年）

东南大学泰州生物医药与医疗器械研究院（2017年）

东南大学溧阳研究院（2017年）

东南大学江北新区创新研究院（2018年）

东南大学玄武设计产业研究院（2018年）

东南大学雄安研究院（2019年）

产研所

东南大学无锡集成电路技术研究所 （2015年）

东南大学南京生物材料与医疗器械研究所 （2015年）

东南大学下一代半导体材料研究所（2018年）